是的，民办学校毕业生可以参加公务员考试。根据相关规定，只要是国家承认的学历，无论是公办还是民办大学，都可以报考公务员。在报考时，需要满足公务员的选拔条件，如具有中华人民共和国国籍、学历要求等。
需要注意的是，某些特定的公务员岗位可能对报考者的院校层次有特定要求，例如公安部的公务员招录可能只允许由省部级单位直接管理的高校毕业生报考。因此，具体情况需要根据当年的公务员招聘公告来确定。
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